A Diocese de Santarém foi criada a 16 de Julho de 1975, pela Bula Apostolicae Sedis Consuetudinem, do Papa Paulo VI, que, no mesmo dia, por outra Bula, nomeou para seu primeiro Bispo, D. António Francisco Marques, que viria a falecer em 28 de Agosto de 1997. De 27 de Janeiro de 1998 a 7 de Outubro de 2017 tomou funções como Bispo de Santarém D. Manuel Pelino Domingues, que continuou em funções como Administrador Apostólico da Diocese até 25 de Novembro de 2017. A 26 de Novembro de 2017 tomou posse D. José Traquina.

A igreja escolhida para Sé Catedral, e indicada na mesma Bula da criação da Diocese, foi a chamada Igreja do Seminário, em Santarém, dedicada à Imaculada Conceição.

O território que constitui a Diocese de Santarém foi separado do Patriarcado de Lisboa, onde formava, desde 29 de Maio de 1976, a Região Pastoral de Santarém.

Toda ela situada no Distrito de Santarém, só 13 dos 21 concelhos distritais (e um deles incompleto) pertencem à Diocese: Alcanena (sem as paróquias de Minde e da Serra de Santo António), Almeirim, Alpiarça, Cartaxo, Chamusca, Entroncamento, Golegã, Rio Maior, Salvaterra de Magos, Santarém, Tomar, Torres Novas e Vila Nova da Barquinha.

São 111 as comunidades paroquiais da Diocese de Santarém que é sufragânea do Patriarcado de Lisboa.